В начале XX века в Санкт-Петербургском горном институте, основанном в 1773 году, возникла необходимость создания своего научного периодического издания. Вопрос об этом неоднократно ставился и обсуждался на заседаниях Совета института. На заседании Совета 3 декабря 1903 года постановили: «считать весьма желательным приступить, если на это окажутся средства, к изданию Известий Горного института…»; 3 мая 1906 года этот вопрос был поставлен его директором - Е.С. Федоровым; 18 октября того же года было принято решение о создании периодического издания; 8 января 1907 года было принято «Положение о «Записках Горного института» и утвержден список статей для публикации в первом томе. В этом списке были статьи профессоров Горного института: И.П. Долбни, В.В. Никитина, Н.С. Курнакова, И.Ф. Шредера, К.И. Богдановича, первой из которых была статья Е.С. Федорова - «Химические отношения горных пород и их графическое построение». Для обеспечения авторского приоритета перед заглавием статьи указывалась дата ее представления в Совет.
Для ознакомления научной общественности с новым изданием было рекомендовано распространить его первый выпуск по высшим учебным заведениям России, Западной Европы и Америки. Первый номер журнала под названием «Записки Горного института императрицы Екатерины II», главным редактором которого стал Е.С. Федоров, вышел 12 ноября 1907 года.
Дальнейшая история «Записок Горного института» делится на 3 этапа:
I этап
Вышло 6 томов, 26 выпусков журнала, содержавших 335 статей по математике, физике, теоретической механике, гидравлике, сопротивлению материалов, химии, металловедению и технологии металлов, металлургии, кристаллографии, минералогии, петрографии, геологии, геодезии. В числе их авторов были известные ученые: математики (М.И. Акимов, А.К. Болдырев, И.П. Долбня, Н.М. Крылов, Н.В. Липин; Е.С. Федоров); физики (Н.П. Неронов), химики (Б.В. Бызов, П.П. Веймарн, П.Я. Сальдау, Н.И. Степанов); кристаллографы (Д.Н. Артемьев, В.М. Дервиз, А.Н. Заварицкий, А.А. Кашинский, В.И. Соколов, Е.С. Федоров); минералоги (А.Э. Купфер, В.В. Никитин, Е.С. Федоров); петрографы (А.Н. Заварицкий, В.Д. Никитин), геодезисты и маркшейдеры (В.И. Бауман, И.М. Бахурин) и др. При этом в «Записках» почти отсутствовали работы по горному делу и геологии.
В 1917 году издание «Записок» было приостановлено до 1926 года, в котором вышел том, посвященный 150-летию Горного института. В нем отмечалась большая роль Е.С. Федорова в создании этого журнала и ставилась цель – «дружное, совместное с другими подобными же органами, содействие развитию наук, связанных с техникой горного и горнозаводского дела и с определенными областями естествознания».
II этап
На II этапе существования «Записок Горного института» вышло 8 томов, 19 выпусков, содержавших 149 статей, значительно полнее отражавших научную деятельность Горного института. В частности, в журнале были значительно расширены разделы по геологии и горному делу. В числе авторов статей были известные ученые: математики (М.И. Акимов, А.М. Журавский), физики (Н.П. Неронов), химики (П.Я. Сальдау), кристаллографы (А.К. Болдырев, В.В. Доливо-Добровольский, В.И. Михеев), минералоги (Д.П. Григорьев), петрографы (А.Н. Заварицкий), геологи (Д.В. Наливкин) и других. В 1941 году, в связи с началом Великой Отечественной войны, выпуск «Записок Горного института» был приостановлен.
III этап
III этап издания журнала начался в 1946 году. На этом этапе развернулся процесс дифференциации наук горно-геологического профиля. Спектр их в журнале значительно расширился, включив в себя статьи по горной технике и экономике горной промышленности. Статьи по горному делу и геологии выдвинулись на ведущее место.
С 1951 года выпуски «Записок» стали тематическими: 1 – горное дело, 2 – геология, 3 – общетехнические, экономические и пр.
На этом этапе в «Записках Горного института» с самого начала публиковались статьи высокого научного уровня, обусловившие последующий авторитет и известность журнала в сообществе ученых. В их числе были статьи по математике (М.Л. Вержбинского, Т.И. Виграненко, Л.С. Гандина, В.Г. Лабазина, П.В. Филиппова); физике, теоретической механики, гидравлике, сопротивлению материалов (Л.С. Бурштейна, А.Ф. Захаревича, Н.П. Неронова, И.И. Тарасенко); химии, электрохимии и металловедению (П.Я. Сальдау); обогащению полезных ископаемых (К.Ф. Белоглазова, Д.С. Емельянова, Г.А. Осолодкова); металлургии, технологии металлов (Н.С. Грейвера, И.Н. Масленицкого, Л.М. Шалыгина); минералогии (В.Д. Никитина, С.А. Руденко, А.В. Скропышева, С.С. Смирнова); петрографии – (А.Н. Заварицкого, В.Д. Никитина, Г.И. Сократова); геологии (Ю.А. Жемчужникова); гидрологии и инженерной геологии (В.И. Давидовича, В.Д. Ломтадзе, В.Н. Новожилова, Н.И. Толстихина); поиску и разведке полезных ископаемых (Н.В. Иванова, Е.О. Погребицкого, В.В. Хохлова, Ф.А. Шамшева); геодезии, маркшейдерскому делу (А.М. Журавского, В.Г. Здановича, Д.А. Казаковского, Л.Н. Келля, И.Н. Ушакова, О.Б. Бокия, В.И. Геронтьева, Е.А. Махно); горной механике, электротехнике, горным машинам (В.С. Берсенева, А.П. Германа, А.В. Рысьева, Л.Ф. Шклярского, Ф.Н. Шклярского), горной экономике (Е.Л. Гороховского, М.В. Мордуховича) и многих других. Заложенные в начале этого этапа научные традиции, получили развитие в публикациях «Записок Горного института» в последующие десятилетия, в том числе и в современных.
Во второй половине XX и начале XXI века дифференциация наук, а вместе с ней и их интеграция усилились. В связи с этим началась активная разработка методологии научных исследований горно-геологического и технического профилей. Все это нашло отражение в содержании и структуре «Записок». Вместе с тем постоянно обновлялся и расширялся круг авторов журнала – авторитетных в своих областях ученых.