Проведено исследование редкоэлементного состава разновидностей берилла (469 анализов методом SIMS). Красные бериллы выделяются повышенным содержанием Ni, Sc, Mn, Fe, Ti, Cs, Rb, K, B и пониженным Na и воды. Розовые бериллы отличаются повышенным содержанием Cs, Rb, Na, Li, Cl и воды при пониженном Mg и Fe. Зеленые бериллы характеризуются повышенным содержанием Cr, V, Mg, Na и воды при пониженном Cs. Особенностью желтых бериллов является пониженное содержание Mg, Cs, Rb, K, Na, Li и Cl. Для бериллов различных оттенков голубого и синего цвета (аквамаринов) характерно повышенное содержание Fe и пониженное Cs и Rb. Для белых бериллов установлено повышенное содержание Na и Li. Метод главных компонент (PCA) c CLR-преобразованием показал, что по первому компоненту происходит обособление зеленых бериллов от других разновидностей. По второму компоненту обособляются розовые и красные бериллы. Метод стохастического вложения соседей с t-распределением (t-SNE) с CLR-преобразованием данных продемонстрировал контрастность составов зеленых бериллов относительно других разновидностей. Красные и розовые бериллы образуют самые компактные кластеры.