С постоянным развитием электроники для управления и контроля работы за ответственными элементами электроэнергетических систем повышаются и требования к качеству электроэнергии. Вопросы повышения качества электроэнергии находят ответы в системах электроснабжения, которые относятся к системообразующим, ввиду их более широкого распространения в отличие от автономных электроэнергетических систем. В свою очередь, с развитием морского и речного флота, с появлением такого перспективного направления для добычи полезных ископаемых, как Арктика, автономные электроэнергетические установки приобретают особую важность. Одной из основных проблем таких систем является малая изученность проблемы качества электроэнергии. В статье представлена модель автономной электроэнергетической системы. Для моделирования таких систем все чаще и чаще используют пакет MathLab с приложением Simulink. С помощью разработанной модели приводится оценка качества электроэнергии в ней, сравнение полученной оценки в существующих системах и предлагается современное решение для улучшения качества электроэнергии.