Гидрохимический и микробиологический мониторинг водных систем Байкальского региона показал, что микроорганизмы являются индикаторами изменений экологического состояния водоемов при техногенных воздействиях. Наибольшая численность микроорганизмов (до 10 7 клеток/мл) выявлена в осадках реки Селенги в районах населенных пунктов. Определение скорости микробных процессов показало, что в местах поступления сточных вод в озеро Байкал в осадках наблюдается смена мета- ногенного сообщества на сульфидогенное. Полученные результаты доказывают необходимость количественной оценки функциональной роли микроорганизмов при экологическом мониторинге водных систем.