Рассмотрены актуальные проблемы российского топливно-энергетического комплекса. Наибольшее внимание уделено проблеме низкого качества продукции нефтепереработки. Рассмотрена концепция ресурсно-инновационного подхода к решению проблемы низкой глубины нефтепереработки. Показана проблема недостатка инвестиций для инновационного развития нефтеперерабатывающих предприятий. Предложены методы экономического стимулирования инвестиционной деятельности в перерабатывающие предприятия нефтяной отрасли. Сделаны выводы о необходимости стимулирования инвестиционной деятельности в нефтяной отрасли, а также создании целеполагающих и регулирующих эту деятельность документов.