В данной статье рассматривается проблема составления методологии по реабилитации окружающей среды, целью которой является научное сопровождение проведения работ по переселению редких и находящихся под угрозой исчезновения видов растений и животных, подвергшихся опасности непосредственного негативного воздействия, при освоении крупных проектов, подвергаются анализу основные особенности данной методологии. И формулируются некоторые позиции по улучшению данной методологии.